Бугагин Денис Владимирович владеет всеми методиками ультразвуковой диагностики органов брюшной полости и забрюшинного пространства, малого таза у мужчин и женщин, молочных (грудных) желез, щитовидной и слюнных желез, сосудов (артерий и вен) конечностей, шеи и головы, сердца (ЭхоКГ), а также 3- и 4-мерного УЗИ (3D и 4D).
Денис Владимирович неоднократно обучался на специализированных курсах на базе Научного центра сердечно-сосудистой хирургии им. А.Н. Бакулева РАМН.